B-DNA

Zleva: A-DNA, B-DNA, Z-DNA
B-DNA - detail

B-DNA je nejčastější druh dvoušroubovice DNA, který za normálních podmínek v buňkách zcela převažuje. Blíží se tradičnímu Watson-Crickovskému modelu dvoušroubovice. Dvoušroubovice B-DNA je pravotočivá, na jednu otáčku připadá cca 10,5 párů bází a průměr dvoušroubovice činí 2 nm.[1] Některé další helikální formy jsou ve srovnání s B-DNA zcela minoritní, ačkoliv zřejmě za určitých okolností mohou vznikat i v buňkách.

Porovnání s A-DNA a Z-DNA

Základní číselné charakteristiky tří nejznámějších helikálních forem DNA
Atribut A-DNA B-DNA Z-DNA
Točivá tendence šroubovice (chiralita) pravotočivá pravotočivá levotočivá
Opakování po každém páru po každém páru po každých dvou párech
Otočení po každém opakování 32,7° 34,3° -60°/2 páry
Průměrný počet párů na jedno otočení šroubovice 11 10,5 12
Sklon páru k ose 20° −1,2° -9°
Vzestup vůči ose na jeden pár 2,3 Å (0,25 nm) 3,32 Å (0,34 nm) 3,8 Å (0,37 nm)
Vzestup vůči ose na jednu otočku 28,2 Å (2,82 nm) 33,2 Å (3,32 nm) 45,6 Å (4,56 nm)
Průměr 23 Å (2,3 nm) 20 Å (2,0 nm) 18 Å (1,8 nm)
Konformace nukleosidu anti anti C: anti, G: syn
Konformace ribofuranózy C3'-endo C2'-endo C: C2'-endo, G: C3'-endo

Reference

  1. Vladimir N. Potaman; Richard R. Sinden. DNA: Alternative Conformations and Biology. [s.l.]: Landes Bioscience, Madame Curie Bioscience Database, 2000-. Dostupné online. 

Externí odkazy

  • Logo Wikimedia Commons Obrázky, zvuky či videa k tématu B-DNA na Wikimedia Commons
Pahýl
Pahýl
Tento článek je příliš stručný nebo postrádá důležité informace.
Pomozte Wikipedii tím, že jej vhodně rozšíříte. Nevkládejte však bez oprávnění cizí texty.
Hlavní typy nukleových kyselin
Stavební kameny
Nukleové báze • Nukleosidy • Nukleotidy • Deoxynukleotidy
Obecná charakteristika
Konformace (A-forma, B-forma, Z-forma) • Počet vláken (dsRNA • ssRNA • dsDNAssDNA • třívláknová DNA • DNA-RNA vlákna)
Deoxyribonukleová kyselina
genomová DNA (gDNA) • komplementární DNA (cDNA) • chloroplastová DNA (cpDNA) • mitochondriální DNA mtDNA • jednořetězcová DNA o více kopiích (msDNA)
Ribonukleová kyselina
kódující
mediátorová RNA (mRNA) (pre-mRNA/hnRNA) • transferová RNA (tRNA) • ribozomální RNA (rRNA)
RNA interference
mikro RNA (miRNA) • malá interferující RNA (siRNA)
Úpravy RNA
malá jaderná RNA (snRNA) • malá jadérková RNA (snoRNA) • guide RNA
Analogy nukleových kyselin
XNA ( GNA / TNA / HNA ) • LNA • PNA • morpholino
Klonovací vektory
Fagemid • Plasmid • Lambda fág • Kosmid • Fosmid • Umělý chromozom odvozený od fága P1 (PAC) bakterií (BAC) kvasinek (YAC) lidských chromozomů HAC