Thyroid Transcription Factor -1

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NKX2-1
Identifiants
AliasesNKX2-1
IDs externesOMIM: 600635 MGI: 108067 HomoloGene: 2488 GeneCards: NKX2-1
Position du gène (Homme)
Chromosome 14 humain
Chr.Chromosome 14 humain[1]
Chromosome 14 humain
Localisation génomique pour NKX2-1
Localisation génomique pour NKX2-1
Locus14q13.3Début36,516,392 bp[1]
Fin36,521,149 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 12 (souris)
Chr.Chromosome 12 (souris)[2]
Chromosome 12 (souris)
Localisation génomique pour NKX2-1
Localisation génomique pour NKX2-1
Locus12 C1|12 24.42 cMDébut56,578,743 bp[2]
Fin56,583,693 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • right lobe of thyroid gland

  • left lobe of thyroid gland

  • lobe inférieur du poumon

  • poumon droit

  • upper lobe of lung

  • upper lobe of left lung

  • buccal mucosa cell

  • epithelium of bronchus

  • cellule épithéliale bronchiale

  • pleura viscéral
Fortement exprimé dans
  • thyroïde

  • urètre

  • male urethra

  • poil

  • tige pituitaire

  • main bronchus

  • langue

  • epithelium of trachea

  • left lung lobe

  • embryon
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ADN
  • sequence-specific DNA binding
  • liaison protéique
  • liaison enzymatique
  • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
  • intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity
  • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Composant cellulaire
  • nucléoplasme
  • noyau
  • transcription regulator complex
Processus biologique
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • processus rythmique
  • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
  • transcription, DNA-templated
  • positive regulation of gene expression
  • negative regulation of cell migration
  • response to hormone
  • forebrain development
  • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis
  • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • migration d'un neurone
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
  • phospholipid metabolic process
  • pattern specification process
  • Guidage axonal
  • développement cérébral
  • endoderm development
  • locomotory behavior
  • morphogenèse d'un organe animal
  • telencephalon development
  • globus pallidus development
  • hippocampus development
  • cerebral cortex cell migration
  • forebrain dorsal/ventral pattern formation
  • forebrain neuron fate commitment
  • forebrain neuron differentiation
  • cerebral cortex GABAergic interneuron differentiation
  • cerebral cortex neuron differentiation
  • pituitary gland development
  • telencephalon cell migration
  • développement des poumons
  • thyroid gland development
  • developmental induction
  • Leydig cell differentiation
  • positive regulation of circadian rhythm
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • structure anatomique impliquée dans la morphogenèse
  • neuron fate commitment
  • oligodendrocyte differentiation
  • lung saccule development
  • club cell differentiation
  • type II pneumocyte differentiation
  • différenciation cellulaire
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

7080

21869

Ensembl

ENSG00000136352

ENSMUSG00000001496

UniProt

P43699

P50220

RefSeq (mRNA)

NM_001079668
NM_003317

NM_001146198
NM_009385

RefSeq (protéine)

NP_001073136
NP_003308

NP_033411
NP_001390509

Localisation (UCSC)Chr 14: 36.52 – 36.52 MbChr 12: 56.58 – 56.58 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Thyroid transcription factor-1 (TTF-1) est une protéine qui régule la transcription de gènes spécifiques à la thyroïde, au poumon et au diencéphale. Elle est aussi connue comme thyroid specific enhancer binding protein. Son gène est le NKX2-1 situé sur le chromosome 14 humain.

On s'en sert en anatomo-pathologie comme marqueur pour déterminer si une tumeur provient des poumons ou de la thyroïde.

Les cellules TTF-1 positives se trouvent dans les pneumocytes de type II et dans les cellules de Clara dans le poumon. Dans la thyroïde, les cellules folliculaires et para folliculaires sont positives.

Pour les cancers du poumon, les adénocarcinomes sont habituellement positifs, alors que les carcinomes à cellules squameuses et à grandes cellules le sont rarement. Les carcinomes à petites cellules (de n'importe quel site primaire) sont habituellement positifs.

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136352 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001496 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
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