ETS1

ETS1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1GVJ, 2NNY, 2STT, 2STW, 3MFK, 3RI4, 3WTS, 3WTT, 3WTU, 3WTV, 3WTW, 3WTX, 3WTY, 3WTZ, 3WU0, 3WU1, 4L0Y, 4L0Z, 4L18, 4LG0

Идентификаторы
ПсевдонимыETS1, ETS-1, EWSR2, p54, c-ets-1, ETS proto-oncogene 1, transcription factor
Внешние IDOMIM: 164720 MGI: 95455 HomoloGene: 3837 GeneCards: ETS1
Расположение гена (человек)
11-я хромосома человека
Хр.11-я хромосома человека[1]
11-я хромосома человека
Расположение в геноме ETS1
Расположение в геноме ETS1
Локус11q24.3Начало128,458,761 bp[1]
Конец128,587,558 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме ETS1
Расположение в геноме ETS1
Локус9 A4|9 17.97 cMНачало32,636,221 bp[2]
Конец32,757,820 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • visceral pleura

  • parietal pleura

  • epithelium of nasopharynx

  • lower lobe of lung

  • epithelium of colon
Наибольшая экспрессия в
  • left lung lobe

  • Gonadal ridge

  • right lung lobe

  • endocardial cushion
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • ДНК-связывающий
  • sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity
  • transcription factor binding
  • связывание с белками плазмы
  • связывание похожих белков
  • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • sequence-specific double-stranded DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
  • histone acetyltransferase binding
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • transcription regulator complex
  • нуклеоплазма
  • клеточное ядро
Биологический процесс
  • regulation of apoptotic process
  • развитие гипофиза
  • response to estradiol
  • response to interleukin-1
  • response to hypoxia
  • ДНК-зависимая регуляция транскрипции
  • positive regulation of erythrocyte differentiation
  • движение клеток
  • эструс
  • immune system process
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
  • response to antibiotic
  • женская беременность
  • angiogenesis involved in wound healing
  • positive regulation of cell migration
  • response to mechanical stimulus
  • response to laminar fluid shear stress
  • negative regulation of cell cycle
  • regulation of angiogenesis
  • transcription by RNA polymerase II
  • regulation of extracellular matrix disassembly
  • транскрипция, ДНК-зависимая
  • positive regulation of endothelial cell migration
  • ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции
  • PML body organization
  • response to wounding
  • иммунный ответ
  • позитивная регуляция пролиферации клеток
  • развитие гипоталамуса
  • negative regulation of inflammatory response
  • положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
  • негативная регуляция пролиферации клеток
  • cellular response to hydrogen peroxide
  • positive regulation of inflammatory response
  • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell
  • positive regulation of gene expression
  • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration
  • positive regulation of angiogenesis
  • дифференцировка клеток
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

2113

23871

Ensembl

ENSG00000134954

ENSMUSG00000032035

UniProt

P14921

P27577

RefSeq (мРНК)

NM_001143820
NM_001162422
NM_005238
NM_001330451

NM_001038642
NM_011808

RefSeq (белок)

NP_001137292
NP_001155894
NP_001317380
NP_005229

NP_001033731
NP_035938
NP_001359463
NP_001359464
NP_001359465

NP_001359466

Локус (UCSC)Chr 11: 128.46 – 128.59 MbChr 9: 32.64 – 32.76 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Белок C-ets-1 (англ. Protein C-ets-1) — белок фактор транскрипции, продукт гена человека ETS1[5]. Входит в семейство факторов транскрипции ETS[6].

Функции

Фактор трансккрипции, который осуществляет прямой контроль экспрессии цитокинов и хемокинов в ходе множества клеточных процессов. Может контролировать дифференцировку, выживание и пролиферацию клеток лимфоидного ряда. Может регулировать ангиогенез за счёт регулирования экспрессии генов, отвечающих за миграцию и инвазию клеток.

Взаимодействия

Ets1 взаимодействует с рядом других факторов транскрипции, образуя мультимолекулярные комплексы. При взаимодействии Ets1 с другими факторами транскрипции (Runx1, Pax5, TFE3, USF1) конечный эффект комплекса зависит от статуса фосфорилирования C-концевого домена Ets1 (фосфорилирование инактивирует его). Ацетилтрансферазы CBP и p300 связывают Ets1. трансактивационный домен. AP1, STAT5 и VDR связываются с C-концевым доменом белка.

Кроме этого, Ets1 связывается с TTRAP,[7] UBE2I[8] и DAXX.[9]

Структура и внутриклеточная локализация

Белок C-ets-1 состоит из 441 аминокислоты, молекулярная масса 50,4 кДа. Локализован в клеточном ядре, может переходить в цитоплазму при связывании изоформы Ets-1 p27.

Экспрессия

Наиболее высокий уровеь экспрессии обнаружен в клетках лимфоидного ряда. Изоформы c-ETS-1A и Ets-1 p27 обнаружены во всех фетальных тканях. В тканях взрослого организма уровень может сильно различаться, отсутствует в мозге и почках.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134954 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032035 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Delattre O., Zucman J., Plougastel B., Desmaze C., Melot T., Peter M., Kovar H., Joubert I., de Jong P., Rouleau G. Gene fusion with an ETS DNA-binding domain caused by chromosome translocation in human tumours (англ.) // Nature : journal. — 1992. — September (vol. 359, no. 6391). — P. 162—165. — doi:10.1038/359162a0. — PMID 1522903.
  6. ↑ Dwyer J., Li H., Xu D., Liu J. P. Transcriptional regulation of telomerase activity: roles of the Ets transcription factor family (англ.) // Annals of the New York Academy of Sciences[англ.] : journal. — 2007. — October (vol. 1114, no. 1). — P. 36—47. — doi:10.1196/annals.1396.022. — PMID 17986575.
  7. ↑ Pei H., Yordy J. S., Leng Q., Zhao Q., Watson D. K., Li R. EAPII interacts with ETS1 and modulates its transcriptional function (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — 2003. — May (vol. 22, no. 18). — P. 2699—2709. — doi:10.1038/sj.onc.1206374. — PMID 12743594.
  8. ↑ Hahn S. L., Wasylyk B., Criqui-Filipe P., Criqui P. Modulation of ETS-1 transcriptional activity by huUBC9, a ubiquitin-conjugating enzyme (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — 1997. — September (vol. 15, no. 12). — P. 1489—1495. — doi:10.1038/sj.onc.1201301. — PMID 9333025.
  9. ↑ Li R., Pei H., Watson D. K., Papas T. S. EAP1/Daxx interacts with ETS1 and represses transcriptional activation of ETS1 target genes (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — 2000. — February (vol. 19, no. 6). — P. 745—753. — doi:10.1038/sj.onc.1203385. — PMID 10698492.

Литература

  • Bonaldo M. F., Lennon G., Soares M. B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
  • Nishihara S., Iwasaki H., Kaneko M. et al. Alpha1,3-fucosyltransferase 9 (FUT9; Fuc-TIX) preferentially fucosylates the distal GlcNAc residue of polylactosamine chain while the other four alpha1,3FUT members preferentially fucosylate the inner GlcNAc residue (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 462, no. 3. — P. 289—294. — doi:10.1016/S0014-5793(99)01549-5. — PMID 10622713.
  • Cailleau-Thomas A., Coullin P., Candelier J. J. et al. FUT4 and FUT9 genes are expressed early in human embryogenesis (англ.) // Glycobiology : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 8. — P. 789—802. — doi:10.1093/glycob/10.8.789. — PMID 10929005.
  • Nakayama F., Nishihara S., Iwasaki H. et al. CD15 expression in mature granulocytes is determined by alpha 1,3-fucosyltransferase IX, but in promyelocytes and monocytes by alpha 1,3-fucosyltransferase IV (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 19. — P. 16100—16106. — doi:10.1074/jbc.M007272200. — PMID 11278338.
  • Roos C., Kolmer M., Mattila P., Renkonen R. Composition of Drosophila melanogaster proteome involved in fucosylated glycan metabolism (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 5. — P. 3168—3175. — doi:10.1074/jbc.M107927200. — PMID 11698403.
  • Toivonen S., Nishihara S., Narimatsu H. et al. Fuc-TIX: a versatile alpha1,3-fucosyltransferase with a distinct acceptor- and site-specificity profile (англ.) // Glycobiology : journal. — 2003. — Vol. 12, no. 6. — P. 361—368. — doi:10.1093/glycob/12.6.361. — PMID 12107078.
  • Li H., Kong Y., Yan B. [Regulation by ovarian hormones of alpha 1,3-fucosyltransferase gene (FUT9) expression in human endometrium] (англ.) // Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao : journal. — 2003. — Vol. 34, no. 6. — P. 775—779. — PMID 12417923.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Nishihara S., Iwasaki H., Nakajima K. et al. Alpha1,3-fucosyltransferase IX (Fut9) determines Lewis X expression in brain (неопр.) // Glycobiology. — 2004. — Т. 13, № 6. — С. 445—455. — doi:10.1093/glycob/cwg048. — PMID 12626397.
  • Mungall A. J., Palmer S. A., Sims S. K. et al. The DNA sequence and analysis of human chromosome 6 (англ.) // Nature : journal. — 2003. — Vol. 425, no. 6960. — P. 805—811. — doi:10.1038/nature02055. — PMID 14574404.
  • Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Bogoevska V., Horst A., Klampe B. et al. CEACAM1, an adhesion molecule of human granulocytes, is fucosylated by fucosyltransferase IX and interacts with DC-SIGN of dendritic cells via Lewis x residues (англ.) // Glycobiology : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 3. — P. 197—209. — doi:10.1093/glycob/cwj057. — PMID 16282604.