Lyaser

Inom biokemi är ett lyas ett enzym som kan katalysera spjälkningsreaktioner. Ett lyas bryter en kovalent bindning under bildande av en dubbelbindning eller en ny ringstruktur,[1] till skillnad från ett hydrolas (en substitutionsreaktion) som bryter en kovalent bindning under konsumtion av en vattenmolekyl. Den omvända reaktionen är också möjlig (kallad Michael-reaktion). Till exempel skulle ett ensym som katalyserar vara ett lyas:

ATP → cAMP + PPi

Lyaser skiljer sig från andra enzymer genom att de endast kräver ett substrat för reaktionen i en riktning, men två substrat för den omvända reaktionen.

Nomenklatur

Systematiska namn bildas som "Substratgrupp-LYAS". Vanliga namn innehåller dekarboxylas, dehydratas, aldolas etc. När produkten är viktigare kan syntas användas i namnet, till exempel fosfosulfolaktatsyntas (EC 4.4.1.19, Michael-addition av sulfit till fosfoenolpyruvat). En kombination av både en eliminering och en Michael-addition ses i O-succinylhomoserin (tiol)-lyas (MetY eller MetZ), som först katalyserar y-elimineringen av O-succinylhomoserin (med succinat som lämnande grupp) och sedan tillsätter sulfid till vinylmellanprodukten, klassificerades först som ett lyas (EC 4.2.99.9), men omklassificerades sedan som ett transferas (EC 2.5.1.48).

Klassificering

Lyaser klassificeras som EC 4 i EG-nummerklassificeringen av enzymer. Lyaser kan ytterligare klassificeras i sju underklasser:

  • EC 4.1 omfattar lyaser som klyver kol-kolbindningar, såsom dekarboxylaser (EC 4.1.1), aldehydlyaser (EC 4.1.2), oxosyralyaser (EC 4.1.3) och andra (EC 4.1.99)
  • EC 4.2 omfattar lyaser som klyver kol-syrebindningar, som dehydrataser
  • EC 4.3 omfattar lyaser som klyver kol-kvävebindningar
  • EC 4.4 omfattar lyaser som klyver kol-svavelbindningar
  • EC 4.5 omfattar lyaser som klyver kol-halidbindningar
  • EC 4.6 omfattar lyaser som klyver fosfor–syrebindningar, som adenylylcyklas och guanylylcyklas
  • EC 4.99 omfattar andra lyaser, såsom ferrochelatas

Membranförbundna lyaser

Vissa lyaser är förbundna med biologiska membran som perifera membranproteiner eller förankrade genom en enda transmembranhelix.[2]

Referenser

Den här artikeln är helt eller delvis baserad på material från engelskspråkiga Wikipedia, Lyase, 1 februari 2023.
  • EC 4 Introduction from the Department of Chemistry at Queen Mary, University of London

Noter

  1. ^ ”Lyase”. www.uniprot.org. https://www.uniprot.org/keywords/456. 
  2. ^ Superfamilies of single-pass transmembrane lyases in Membranome database

Externa länkar

  • Wikimedia Commons har media som rör Lyaser.
v • r
Enzymer
Aktivitet
Aktivt centrum · Enzymkatalys · Kofaktor
Reglering
Alloster reglering · Enzymaktivator
Klassificering
EC-nummer
Kinetik
Typer
EC1 Oxidoreduktaser · EC2 Transferaser · EC3 Hydrolaser · EC4 Lyaser · EC5 Isomeraser · EC6 Ligaser