Аполіпопротеїн D

Аполіпротеїн D

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2HZQ, 2HZR

Ідентифікатори

Символи

APOD, Apod, apolipoprotein D

Зовнішні ІД

OMIM: 107740 MGI: 88056 HomoloGene: 1246 GeneCards: APOD

Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipid transporter activity • transporter activity • cholesterol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • small molecule binding • lipid binding
Клітинна компонента	• cytosolic ribosome • внутрішньоклітинний • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • екзосома • міжклітинний простір • extracellular region • цитоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of T cell migration • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of monocyte chemotactic protein-1 production • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • tissue regeneration • lipid metabolism • GO:0001315 response to reactive oxygen species • negative regulation of smooth muscle cell-matrix adhesion • GO:0010260 старіння людини • negative regulation of lipoprotein lipid oxidation • brain development • peripheral nervous system axon regeneration • response to axon injury • Ангіогенез • glucose metabolic process • negative regulation of focal adhesion assembly • negative regulation of protein import into nucleus • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • lipid transport • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


347


11815

Ensembl


ENSG00000189058


ENSMUSG00000022548

UniProt


P05090


P51910

RefSeq (мРНК)


NM_001647


NM_001301353 NM_001301354 NM_007470

RefSeq (білок)


NP_001638


NP_001288282 NP_001288283 NP_031496

Локус (UCSC)

Хр. 3: 195.57 – 195.58 Mb

Хр. 16: 31.12 – 31.13 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Аполіпротеїн D (англ. Apolipoprotein D) – білок, який кодується геном APOD, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 189 амінокислот, а молекулярна маса — 21 276^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVMLLLLLSA	LAGLFGAAEG	QAFHLGKCPN	PPVQENFDVN	KYLGRWYEIE
KIPTTFENGR	CIQANYSLME	NGKIKVLNQE	LRADGTVNQI	EGEATPVNLT
EPAKLEVKFS	WFMPSAPYWI	LATDYENYAL	VYSCTCIIQL	FHVDFAWILA
RNPNLPPETV	DSLKNILTSN	NIDVKKMTVT	DQVNCPKLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як транспорт. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Holzfeind P., Merschak P., Dieplinger H., Redl B. (1995). The human lacrimal gland synthesizes apolipoprotein D mRNA in addition to tear prealbumin mRNA, both species encoding members of the lipocalin superfamily. Exp. Eye Res. 61: 495—500. PMID 8549691 DOI:10.1016/S0014-4835(05)80145-9
Balbin M., Freije J.M.P., Fueyo A., Sanchez L.M., Lopez-Otin C. (1990). Apolipoprotein D is the major protein component in cyst fluid from women with human breast gross cystic disease. Biochem. J. 271: 803—807. PMID 2244881 DOI:10.1042/bj2710803
Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry. Proteomics. 4: 454—465. PMID 14760718 DOI:10.1002/pmic.200300556
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Schindler P.A., Settineri C.A., Collet X., Fielding C.J., Burlingame A.L. (1995). Site-specific detection and structural characterization of the glycosylation of human plasma proteins lecithin:cholesterol acyltransferase and apolipoprotein D using HPLC/electrospray mass spectrometry and sequential glycosidase digestion. Protein Sci. 4: 791—803. PMID 7613477 DOI:10.1002/pro.5560040419

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:612 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.
↑ UniProt, P05090 (англ.) . Архів оригіналу за 5 лютого 2017. Процитовано 30 січня 2017.