PDLIM4 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PDLIM4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EEG, 2V1W, 4Q2O

Ідентифікатори

Символи

PDLIM4, RIL, PDZ and LIM domain 4

Зовнішні ІД

OMIM: 603422 MGI: 1353470 HomoloGene: 2735 GeneCards: PDLIM4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase binding • protein homodimerization activity • alpha-actinin binding • actin binding • muscle alpha-actinin binding
Клітинна компонента	• stress fiber • early endosome lumen • filamentous actin • recycling endosome lumen • postsynaptic membrane • клітинне ядро • цитоплазма • ендосома • цитоскелет • мембрана • lamellipodium • міжклітинні контакти • early endosome membrane • cell projection • neuron projection • dendritic spine • синапс • perinuclear region of cytoplasm • recycling endosome membrane • Z disc
Біологічний процес	• actin cytoskeleton reorganization • excitatory chemical synaptic transmission • heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8572


30794

Ensembl


ENSG00000131435


ENSMUSG00000020388

UniProt


P50479


P70271

RefSeq (мРНК)


NM_003687 NM_001131027


NM_019417

RefSeq (білок)


NP_001124499 NP_003678


NP_062290

Локус (UCSC)

Хр. 5: 132.26 – 132.27 Mb

Хр. 11: 53.95 – 53.96 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDLIM4 (англ. PDZ and LIM domain 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 35 398^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPHSVTLRGP	SPWGFRLVGG	RDFSAPLTIS	RVHAGSKAAL	AALCPGDLIQ
AINGESTELM	THLEAQNRIK	GCHDHLTLSV	SRPEGRSWPS	APDDSKAQAH
RIHIDPEIQD	GSPTTSRRPS	GTGTGPEDGR	PSLGSPYGQP	PRFPVPHNGS
SEATLPAQMS	TLHVSPPPSA	DPARGLPRSR	DCRVDLGSEV	YRMLREPAEP
VAAEPKQSGS	FRYLQGMLEA	GEGGDWPGPG	GPRNLKPTAS	KLGAPLSGLQ
GLPECTRCGH	GIVGTIVKAR	DKLYHPECFM	CSDCGLNLKQ	RGYFFLDERL
YCESHAKARV	KPPEGYDVVA	VYPNAKVELV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16501 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, P50479 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.