Nukleosid

Nukleosidy se skládají z pětiuhlíkového sacharidu (ribózy nebo deoxyribózy) a z nukleové báze (ze skupiny purinů nebo pyrimidinů). Nukleosidy jsou základní molekulární stavební kameny nukleotidů, od kterých se liší tím, že neobsahují kyselinu fosforečnou. V živých organismech jsou nukleosidy jako součást nukleotidů nositeli genetické informace.

Ribonukleosidy a deoxyribonukleosidy

Pokud nukleosidy obsahují sacharid D-ribózu, nazývají se ribonukleosidy. Pokud obsahují sacharid 2-deoxy-D-ribózu nazývají se deoxyribonukleosidy nebo častěji pouze deoxynukleosidy. Sacharid je v nukleosidech vázán N-glykosidovou vazbou k dusíku purinového nebo pyrimidinového kruhu. Tyto kovalentní vazby spojují anomerní uhlík pentózy a atom dusíku N9 (v případě purinové báze) nebo dusíku N1 (v případě pyrimidinové báze).

Názvosloví nukleosidů

Nukleová báze Nukleosid Deoxynukleosid
Struktura adeninu
Adenin
Struktura anenosinu
Adenosin (A)
Struktura deoxyadenosinu
Deoxyadenosin (dA)
Struktura guaninu
Guanin
Struktura guanosinu
Guanosin (G)
Struktura deoxyguanosinu
Deoxyguanosin (dG)
Struktura thyminu
Thymin
Structura 5-methyluridinu
5-Methyluridin (m5U)
Struktura deoxythymidinu
Thymidin (dT)
Struktura uracilu
Uracil
Struktura uridinu
Uridin (U)
Struktura deoxyuridinu
Deoxyuridin (dU)
Struktura cytosinu
Cytosin
Struktura cytidinu
Cytidin (C)
Struktura deoxycytidinu
Deoxycytidin (dC)

Nukleosidy patří mezi glykosylaminy a jejich název je odvozen od nukleové báze, kterou obsahují, přidáním koncovky -sin. Z adeninu je odvozen adenosin, z guaninu guanosin a další. Tak se nazývají nukleosidy obsahující ribózu. Ty, které obsahují deoxyribózu, se nazývají deoxyadenosin, deoxyguanosin a další.

Nukleosidy mohou na základě rotace kolem glykosidové vazby existovat v konformacích: syn nebo anti. V přírodě převažují antikonformery, které jsou zobrazené na obrázcích vpravo.

Nukleosidové analogy

Nukleosidové analogy hrají důležitou roli zejména v antiretrovirové terapii. Řada moderních antivirotik obsahuje právě tyto látky.

  • Pravděpodobně nejznámější je účinná látka acyklovir (analog guanosinu), která se často používá proti virům herpes simplex (HSV-1 a -2).
  • Ganciclovir, který je stejně jako acyklovir analog guanosinu, potlačuje replikaci CMV.
  • Některé nukleosidové analogy se požívají pro léčbu rakoviny. Jako cytostatika se používají například sloučeniny 5-fluorouracil a cytarabin.

Nukleosidy a nukleotidy

Rozdíl mezi nukleosidem a nukleotidem. Nukleosid neobsahuje zbytek kyseliny fosforečné, nukleotid obsahuje nejméně jeden zbytek kyseliny fosforečné.

Nukleotidy vznikají z nukleosidů fosforylací (navázáním fosfátu, tedy zbytku kyseliny fosforečné) na hydroxylovou skupinu sacharidů. Nukleotidy jsou základními stavebními kameny nukleových kyselin DNA a RNA. Účastní se buněčné komunikace, biologických syntéz a přenosu volné energie v buňce.

Nukleotidy a nukleové kyseliny

Nukleové kyseliny jsou sloučeniny vzniklé syntézou jednotlivých nukleotidů za vzniku makromolekulárních polynukleotidů. Jednotlivé nukleotidy mají schopnost vytvářet řetězce, jejichž páteř tvoří zbytek kyseliny fosforečné a sacharid. Na tu jsou pak navázány nukleové báze. Nukleových kyselin je podle různých pořadí a kombinací nukleových bází prakticky nekonečné množství. Dvě základní skupiny nukleových kyselin jsou kyseliny ribonukleové a kyseliny deoxyribonukleové.

Kyselina ribonukleová RNA obsahuje kromě zbytku kyseliny fosforečné sacharid ribózu a čtyři nukleové báze: adenin (A), guanin (G), cytosin (C) a uracil (U). Molekula je tvořena jedním řetězcem ve tvaru šroubovice. RNA je mnohem méně stabilní, než je DNA.

Kyselina deoxyribonukleová DNA obsahuje kromě zbytku kyseliny fosforečné sacharid deoxyribózu a čtyři báze: adenin (A), guanin (G), cytosin (C) a thymin (T). V DNA se tedy místo uracilu vyskytuje thymin. Molekula je tvořena dvěma řetězci, které vytvářejí dvojitou šroubovici, v níž jsou protilehlé báze navzájem propojeny vodíkovými můstky mezi atomy dusíku a kyslíku. Tvar lze přirovnat ke stočenému provazovému žebříku, kde řetězce deoxyribózy a zbytku kyseliny fosforečné představují postranní lana a vodíkové můstky jednotlivé příčky. DNA je mnohem stabilnější než RNA, neboť musí v buňkách vydržet po celý život.

Reference

V tomto článku byly použity překlady textů z článků Nukleoside na německé Wikipedii a Nucleoside na anglické Wikipedii.

Externí odkazy

Hlavní typy nukleových kyselin
Stavební kameny
Obecná charakteristika
Konformace (A-forma, B-forma, Z-forma) • Počet vláken (dsRNAssRNAdsDNAssDNA • třívláknová DNA • DNA-RNA vlákna)
Deoxyribonukleová kyselina
genomová DNA (gDNA) • komplementární DNA (cDNA) • chloroplastová DNA (cpDNA) • mitochondriální DNA mtDNA • jednořetězcová DNA o více kopiích (msDNA)
Ribonukleová kyselina
kódující
mediátorová RNA (mRNA) (pre-mRNA/hnRNA) • transferová RNA (tRNA) • ribozomální RNA (rRNA)
RNA interference
mikro RNA (miRNA) • malá interferující RNA (siRNA)
Úpravy RNA
malá jaderná RNA (snRNA) • malá jadérková RNA (snoRNA) • guide RNA
Analogy nukleových kyselin
XNA ( GNA / TNA / HNA ) • LNA • PNA • morpholino
Klonovací vektory
Fagemid • Plasmid • Lambda fág • Kosmid • Fosmid • Umělý chromozom odvozený od fága P1 (PAC) bakterií (BAC) kvasinek (YAC) lidských chromozomů HAC
Složky nukleových kyselin
Nukleové báze
Purinové
Pyrimidinové
Běžné modifikace nukleových bází
V RNA
AdeninXantin, HypoxantinGuanin → 7-methylguanin • UracilThymin (5-methyluracil), Dihydrouridin
V DNA
AdeninN6-methyladenin • Thymin → báze J • Cytosin → 4-methylcytosin, 5-methylcytosin, 5-hydroxymethylcytosin, 5-formylcytosin, 5-karboxylcytosin
Nukleosidy
AdenosinUridinGuanosinCytidin • modifikované: Pseudouridin, Ribothymidin, Inosin (jako bázi obsahuje hypoxantin)
Deoxynukleosidy
Ribonukleotidy
AMP (cAMP) • UMPGMP (cGMP) • CMPADP • UDP (m5UDP) • GDP • CDP • ATPUTPGTPCTP
Deoxyribonukleotidy
dAMP • dTMP • dUMP • dGMP • dCMP • dADP • dTDP • dUDP • dGDP • dCDP • dATP • dTTP • dUTP (m5UTP) • dGTPdCTP
Analogy nukleových kyselin
GNA • LNA • PNA • TNA • morpholino • syntetické purinové analogy • syntetické pyrimidinové analogy
Autoritní data Editovat na Wikidatech
  • NKC: ph123362
  • BNE: XX534597
  • BNF: cb12144469g (data)
  • GND: 4133402-4
  • LCCN: sh85093157
  • NDL: 00568740
  • NLI: 987007538643705171