Pseudouridin

pseudouridin

Obecné
Sumární vzorec	C₉H₁₂N₂O₆
Identifikace
Registrační číslo CAS	1445-07-4
Vlastnosti
Molární hmotnost	244,069 536 Da
Není-li uvedeno jinak, jsou použity jednotky SI a STP (25 °C, 100 kPa). Některá data mohou pocházet z datové položky.

Pseudouridin (Ψ, systematicky 5-β-D-ribofuranosyluracil či 5-ribosyluracil) je neobvyklý nukleosid tvořený ribózou a uracilem, jenž je připojen na ribózu C-glykosidickou vazbou. Od uridinu se liší konkrétní pozicí cyklu, jímž je uracil k ribóze připojen (u uridinu je to 1' dusík, u pseudouridinu 5' uhlík uracilu).

Jedná se o vzácnější nukleosid, který však je součástí například molekul transferové RNA (tRNA, zejména v T-raménku) i v ribozomální RNA (rRNA) a v malé jaderné RNA (snRNA).^[1] Pokud se vyskytuje v antikodonu, pak páruje s adeninem. Pseudouridin vzniká z uridinu až po transkripci, tedy modifikací existující RNA, a to pomocí pseudouridinsyntáz.^[2] K celé řadě úprav dochází v jadérku a na řízení celého procesu mají zásadní roli malé molekuly jadérkové RNA (snoRNA).^[1] Při modifikaci rRNA v jadérku je uridin určený k modifikaci rozpoznán malou jadérkovou RNA třídy H/ACA box, která se přesně váže v bezprostřední blízkosti nukleotidu určeného k modifikaci, ale samotný uridin vystavuje k úpravě enzymem pseudouridin syntázou.^[3] Mutace jedné z těchto syntáz může vyústit až v onemocnění dyskeratosis congenita,^[2] jiné zase v myopatické a anemické onemocnění MLASA,^[4] takže je zřejmé, že pseudouridin v různých RNA plní závažné role. Po degradaci RNA se uvolňuje volný pseudouridin a protože neexistuje enzym, jenž by ho rozložil, je vylučován v intaktním stavu močí.^[5]

Reference

↑ ^a ^b RÉDEI, George P. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. 3rd Edition. vyd. [s.l.]: Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2.
↑ ^a ^b Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology; revised edition. Příprava vydání R. Cammack et al. New York: Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1.
↑ CHARETTE, M.; GRAY, MW. Pseudouridine in RNA: what, where, how, and why.. IUBMB Life. May 2000, roč. 49, čís. 5, s. 341–51. DOI 10.1080/152165400410182. PMID 10902565.
↑ PATTON, J. R.; BYKHOVSKAYA, Y.; MENGESHA, E., et al. Mitochondrial myopathy and sideroblastic anemia (MLASA): missense mutation in the pseudouridine synthase 1 (PUS1) gene is associated with the loss of tRNA pseudouridylation. J Biol Chem.. 2005, roč. 280, čís. 20, s. 19 823 – 19 828. Dostupné online. ISSN 0021-9258.
↑ MURRAY, Robert K., Daryl K. Granner, Peter A. Mayes, Victor W. Rodwell. Harper's Illustrated Biochemistry. [s.l.]: Lange Medical Books/McGraw-Hill; Medical Publishing Division, 2003. ISBN 0-07-138901-6.

Externí odkazy

Obrázky, zvuky či videa k tématu pseudouridin na Wikimedia Commons

Tento článek je příliš stručný nebo postrádá důležité informace.
Pomozte Wikipedii tím, že jej vhodně rozšíříte. Nevkládejte však bez oprávnění cizí texty.

Složky nukleových kyselin

Nukleové báze


Purinové	Adenin • Guanin

Pyrimidinové	Thymin • Uracil • Cytosin

Běžné modifikace nukleových bází


V RNA	Adenin → Xantin, Hypoxantin • Guanin → 7-methylguanin • Uracil → Thymin (5-methyluracil), Dihydrouridin

V DNA	Adenin → N⁶-methyladenin • Thymin → báze J • Cytosin → 4-methylcytosin, 5-methylcytosin, 5-hydroxymethylcytosin, 5-formylcytosin, 5-karboxylcytosin