DNK polimeraza I

DNA polimeraza I
Funkcionalni domeni u Klenovom fragmentu (levo) i DNK polimerazi I (desno).
Identifikatori
Organizam Escherichia coli
(vrsta K-12, podvrsta MG1655)
Simbol polA
Entrez 948356
PDB 1DPI
RefSeq (Prot) NP_418300.1
UniProt P00582
Other data
EC broj 2.7.7.7
Hromozom genome: 4.04 - 4.05 Mb

DNK polimeraza I (Pol I) je enzim koji učestvuje u procesu replikacije DNK. Ovaj enzim je otkrio Artur Kornberg 1956. godine.[1] To je bila prva poznata DNK polimeraza (kao i prva poznata polimeraza bilo koje vrste). Ovaj enzim je inicijalno bio okarakterisan kod E. coli, a kasnije je utrvđeno da je sveprisutan kod prokariota. Kod E. coli i mnogih drugih bakterija, gen koji kodira Pol I je poznat kao polA. E. coli forma ovog enzima se sastoji od 928 aminokiselina, i primer je procesivnog enzima - koji može sekvenciono da katalizuje višestruke polimerizacije.

Pol I poseduje četiri enzimske funkcije:

  1. 5' -> 3' (u napred) DNK-zavisna DNK polimerazna aktivnost, za koju je neophodno 3' prajmersko mesto i šablonski lanac
  2. 3' -> 5' (u nazad) egzonukleazna aktivnost kojom se posreduje korektura
  3. 5' -> 3' (u napred) egzonukleazna aktivitnost koja posreduje nik translacija tokom DNK popravke.
  4. 5' -> 3' (u napred) RNK-zavisna DNK polimerazna aktivnost. Pol I deluje na RNK šablonima sa znatno manjom efikasnošću (0.1–0.4%) u odnosu na DNK šablone, i to dejstvo verovatno ima samo ograničen biološki značaj.[2]

Vidi još

  • DNK polimeraza II
  • DNK polimeraza III

Reference

  1. Lehman IR, Bessman MJ, Simms ES, Kornberg A (July 1958). „Enzymatic synthesis of deoxyribonucleic acid. I. Preparation of substrates and partial purification of an enzyme from Escherichia coli”. J. Biol. Chem. 233 (1): 163–70. PMID 13563462. 
  2. Ricchetti M, Buc H (February 1993). „E. coli DNA polymerase I as a reverse transcriptase”. EMBO J. 12 (2): 387–96. PMC 413221. PMID 7679988. 
  • p
  • r
  • u
Transferaze: fosfor-sadržavajuće grupe (EC 2.7)
2.7.1-2.7.4:
fosfotransferaze/kinaze
(PO4)
2.7.1: OH- akceptor
2.7.2: COOH akceptor
2.7.3: N akceptor
2.7.4: PO4 akceptor
2.7.6: difosfotransferaze
(P2O7)2.7.7: nukleotidiltransferaza
(PO4-nukleozid)
RNK nukleotidiltransferaza
Druge
2.7.8: razno
Fosfatidiltransferaze
Glikozil-1-fosfotransferaza
2.7.10-2.7.13: proteinske kinaze
(PO4; proteinski akceptor)
vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.12: dualna specifičnost
vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.13: protein-histidinske
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
Separacija
i inicijacija
Prokariotska
(inicijacija)
Eukariotska
(priprema u
G1 fazi)
Oba
Replikacija
Prokariotska
(elongacija)
Eukariotska
(sinteza u
S fazi)
Oba
Kretanje: Procesivnost  DNK ligaza
Terminacija
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr)  tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts)  tltn (risu, pttl, nexn)  dnab, rnab/runp  stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)