DNK polimeraza I
DNA polimeraza I | |
---|---|
Funkcionalni domeni u Klenovom fragmentu (levo) i DNK polimerazi I (desno). | |
Identifikatori | |
Organizam | Escherichia coli (vrsta K-12, podvrsta MG1655) |
Simbol | polA |
Entrez | 948356 |
PDB | 1DPI |
RefSeq (Prot) | NP_418300.1 |
UniProt | P00582 |
Other data | |
EC broj | 2.7.7.7 |
Hromozom | genome: 4.04 - 4.05 Mb |
DNK polimeraza I (Pol I) je enzim koji učestvuje u procesu replikacije DNK. Ovaj enzim je otkrio Artur Kornberg 1956. godine.[1] To je bila prva poznata DNK polimeraza (kao i prva poznata polimeraza bilo koje vrste). Ovaj enzim je inicijalno bio okarakterisan kod E. coli, a kasnije je utrvđeno da je sveprisutan kod prokariota. Kod E. coli i mnogih drugih bakterija, gen koji kodira Pol I je poznat kao polA. E. coli forma ovog enzima se sastoji od 928 aminokiselina, i primer je procesivnog enzima - koji može sekvenciono da katalizuje višestruke polimerizacije.
Pol I poseduje četiri enzimske funkcije:
- 5' -> 3' (u napred) DNK-zavisna DNK polimerazna aktivnost, za koju je neophodno 3' prajmersko mesto i šablonski lanac
- 3' -> 5' (u nazad) egzonukleazna aktivnost kojom se posreduje korektura
- 5' -> 3' (u napred) egzonukleazna aktivitnost koja posreduje nik translacija tokom DNK popravke.
- 5' -> 3' (u napred) RNK-zavisna DNK polimerazna aktivnost. Pol I deluje na RNK šablonima sa znatno manjom efikasnošću (0.1–0.4%) u odnosu na DNK šablone, i to dejstvo verovatno ima samo ograničen biološki značaj.[2]
Vidi još
- DNK polimeraza II
- DNK polimeraza III
Reference
- ↑ Lehman IR, Bessman MJ, Simms ES, Kornberg A (July 1958). „Enzymatic synthesis of deoxyribonucleic acid. I. Preparation of substrates and partial purification of an enzyme from Escherichia coli”. J. Biol. Chem. 233 (1): 163–70. PMID 13563462.
- ↑ Ricchetti M, Buc H (February 1993). „E. coli DNA polymerase I as a reverse transcriptase”. EMBO J. 12 (2): 387–96. PMC 413221. PMID 7679988.
- p
- r
- u
fosfotransferaze/kinaze
(PO4)
2.7.1: OH- akceptor | Hekso- • Gluko- • Frukto- (Hepatička) • Galakto- • Fosfofrukto- (1, Jetra, Mišić, Trombocit, 2) • Riboflavin • Šikimat • Timidin (ADP-timidin) • NAD+ • Glicerol • Pantotenat • Mevalonat • Piruvat • Deoksicitidin • PFP • Diacilglocerol • Fosfoinozitid 3 (Klasa I PI 3, Klasa II PI 3) • Sfingozin • Glukoza-1,6-bisfosfat sintaza |
---|---|
2.7.2: COOH akceptor | |
2.7.3: N akceptor | |
2.7.4: PO4 akceptor |
(P2O7)
(PO4-nukleozid)
| |||||
Druge |
Fosfatidiltransferaze | |
---|---|
Glikozil-1-fosfotransferaza |
(PO4; proteinski akceptor)
2.7.10: proteinske-tirozinske | vidi tirozinske kinaze |
---|---|
2.7.11: proteinske-serin/treonin | vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze |
2.7.12: dualna specifičnost | vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze |
2.7.13: protein-histidinske |
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6