CHRNB2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2K58, 2K59, 2KSR, 2LM2

Ідентифікатори

Символи

CHRNB2, EFNL3, nAChRB2, cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit

Зовнішні ІД

OMIM: 118507 MGI: 87891 HomoloGene: 595 GeneCards: CHRNB2

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal dominant nocturnal frontal lobe epilepsy 3^[1]

Реагує на сполуку

pozanicline, ispronicline^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• acetylcholine binding • acetylcholine receptor activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ligand-gated ion channel activity • protein heterodimerization activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • acetylcholine-gated cation-selective channel activity • transmembrane signaling receptor activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
Клітинна компонента	• acetylcholine-gated channel complex • integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • external side of plasma membrane • integral component of plasma membrane • neuron projection • plasma membrane raft • dopaminergic synapse • cholinergic synapse • integral component of presynaptic membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane
Біологічний процес	• visual learning • regulation of synaptic transmission, dopaminergic • response to cocaine • smooth muscle contraction • regulation of circadian sleep/wake cycle, REM sleep • regulation of dopamine secretion • response to hypoxia • associative learning • когнітивність • locomotory behavior • protein heterooligomerization • central nervous system neuron axonogenesis • optic nerve morphogenesis • regulation of synapse assembly • regulation of membrane potential • response to nicotine • membrane depolarization • nervous system process • synaptic transmission, cholinergic • ion transport • слух • навчення • пам'ять • negative regulation of action potential • regulation of dopamine metabolic process • behavioral response to nicotine • regulation of dendrite morphogenesis • B cell activation • neuromuscular synaptic transmission • synaptic transmission involved in micturition • positive regulation of dopamine secretion • positive regulation of B cell proliferation • regulation of circadian sleep/wake cycle, non-REM sleep • vestibulocochlear nerve development • conditioned taste aversion • GO:0015915 транспорт • соціальна поведінка • потенціал дії • sensory perception of pain • lateral geniculate nucleus development • positive regulation of synaptic transmission, dopaminergic • response to ethanol • central nervous system projection neuron axonogenesis • calcium ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • ion transmembrane transport • regulation of postsynaptic membrane potential • excitatory postsynaptic potential • acetylcholine receptor signaling pathway • chemical synaptic transmission • response to acetylcholine • regulation of synaptic vesicle exocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1141


11444

Ensembl


ENSG00000160716


ENSMUSG00000027950

UniProt


P17787


Q9ERK7

RefSeq (мРНК)


NM_000748


NM_009602

RefSeq (білок)


NP_000739


NP_033732

Локус (UCSC)

Хр. 1: 154.57 – 154.58 Mb

Хр. 3: 89.65 – 89.67 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CHRNB2 (англ. Cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 57 019^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARRCGPVAL	LLGFGLLRLC	SGVWGTDTEE	RLVEHLLDPS	RYNKLIRPAT
NGSELVTVQL	MVSLAQLISV	HEREQIMTTN	VWLTQEWEDY	RLTWKPEEFD
NMKKVRLPSK	HIWLPDVVLY	NNADGMYEVS	FYSNAVVSYD	GSIFWLPPAI
YKSACKIEVK	HFPFDQQNCT	MKFRSWTYDR	TEIDLVLKSE	VASLDDFTPS
GEWDIVALPG	RRNENPDDST	YVDITYDFII	RRKPLFYTIN	LIIPCVLITS
LAILVFYLPS	DCGEKMTLCI	SVLLALTVFL	LLISKIVPPT	SLDVPLVGKY
LMFTMVLVTF	SIVTSVCVLN	VHHRSPTTHT	MAPWVKVVFL	EKLPALLFMQ
QPRHHCARQR	LRLRRRQRER	EGAGALFFRE	APGADSCTCF	VNRASVQGLA
GAFGAEPAPV	AGPGRSGEPC	GCGLREAVDG	VRFIADHMRS	EDDDQSVSED
WKYVAMVIDR	LFLWIFVFVC	VFGTIGMFLQ	PLFQNYTTTT	FLHSDHSAPS
SK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Anand R., Lindstrom J. (1990). Nucleotide sequence of the human nicotinic acetylcholine receptor beta 2 subunit gene. Nucleic Acids Res. 18: 4272—4272. PMID 2377478 DOI:10.1093/nar/18.14.4272
Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32. FEBS Lett. 400: 309—314. PMID 9009220 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
Rempel N., Heyers S., Engels H., Sleegers E., Steinlein O.K. (1998). The structures of the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta2- and alpha3-subunit genes (CHRNB2 and CHRNA3). Hum. Genet. 103: 645—653. PMID 9921897 DOI:10.1007/s004390050885
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kouvatsos N., Giastas P., Chroni-Tzartou D., Poulopoulou C., Tzartos S.J. (2016). Crystal structure of a human neuronal nAChR extracellular domain in pentameric assembly: Ligand-bound alpha2 homopentamer. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 9635—9640. PMID 27493220 DOI:10.1073/PNAS.1602619113
Bondarenko V., Tillman T., Xu Y., Tang P. (2010). NMR structure of the transmembrane domain of the n-acetylcholine receptor beta2 subunit. Biochim. Biophys. Acta. 1798: 1608—1614. PMID 20441771 DOI:10.1016/j.bbamem.2010.04.014

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CHRNB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1962 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P17787 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Ліганд-залежні іонні канали

Cys-петельні

Серотонін	5-HT₃ A B C D E

ГАМК	ГАМК_А α₁ α₂ α₃ α₄ α₅ α₆ β₁ β₂ β₃ γ₁ γ₂ γ₃ δ ε π θ ГАМК_А-ρ ρ₁ ρ₂ ρ₃

Гліцин	α₁ α₂ α₃ α₄ β

Нікотин ацетилхолін	мономери: α1 α2 α3 α4 α5 α6 α7 α9 α10 β1 β2 β3 β4 δ ε пентамери: (α3)₂(β4)₃ (α4)₂(β2)₃ (α7)₅ (α1)₂(β4)₃ (α1)₂β1δε

Цинк	ZACN

Іонотропні глутаматні

Тільки ліганд-залежні	AMPA (1 2 3 4) Каїнат 1 2 3 4 5

Потенціал- та ліганд-залежні	NMDA 1 2A 2B 2C 2D 3A 3B L1A L1B

Орфанні	GluD δ₁ δ₂