| GRIA4 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | GRIA4, GLUR4, GLUR4C, GLURD, GluA4, glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4, NEDSGA, GluA4-ATD |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 138246 MGI: 95811 HomoloGene: 20227 GeneCards: GRIA4 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| аметропія[1] |
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| AMPA, Анірацетам, cx516, CX546, Циклотіазид, IDRA-21, пірацетам, S-18986, GYKI 53655, GYKI-52,466, NBQX, Тезампанел, Аргіотоксин 636, Токсин Джоро[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • ion channel activity
• ionotropic glutamate receptor activity
• extracellularly glutamate-gated ion channel activity
• excitatory extracellular ligand-gated ion channel activity
• AMPA glutamate receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• amyloid-beta binding
• signaling receptor activity
|
|---|
| Клітинна компонента | • extracellular vesicle
• integral component of membrane
• endocytic vesicle membrane
• postsynaptic membrane
• cell projection
• мембрана
• клітинна мембрана
• синапс
• міжклітинні контакти
• дендрит (нейробіологія)
• AMPA glutamate receptor complex
• neuronal cell body
• dendritic spine
|
|---|
| Біологічний процес | • glutamate receptor signaling pathway
• ion transport
• ion transmembrane transport
• ionotropic glutamate receptor signaling pathway
• excitatory postsynaptic potential
• GO:0015915 транспорт
• regulation of NMDA receptor activity
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_000829
NM_001077243
NM_001077244
NM_001112812 |
| | NM_001113180
NM_001113181
NM_019691 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_000820
NP_001070711
NP_001070712
NP_001106283 |
| | NP_001106651
NP_001106652
NP_062665 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 11: 105.61 – 105.98 Mb | Хр. 9: 4.42 – 4.8 Mb |
|---|
| PubMed search | [3] | [4] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GRIA4 (англ. Glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 902 амінокислот, а молекулярна маса — 100 871[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MRIISRQIVL | | LFSGFWGLAM | | GAFPSSVQIG | | GLFIRNTDQE | | YTAFRLAIFL |
| HNTSPNASEA | | PFNLVPHVDN | | IETANSFAVT | | NAFCSQYSRG | | VFAIFGLYDK |
| RSVHTLTSFC | | SALHISLITP | | SFPTEGESQF | | VLQLRPSLRG | | ALLSLLDHYE |
| WNCFVFLYDT | | DRGYSILQAI | | MEKAGQNGWH | | VSAICVENFN | | DVSYRQLLEE |
| LDRRQEKKFV | | IDCEIERLQN | | ILEQIVSVGK | | HVKGYHYIIA | | NLGFKDISLE |
| RFIHGGANVT | | GFQLVDFNTP | | MVIKLMDRWK | | KLDQREYPGS | | ETPPKYTSAL |
| TYDGVLVMAE | | TFRSLRRQKI | | DISRRGNAGD | | CLANPAAPWG | | QGIDMERTLK |
| QVRIQGLTGN | | VQFDHYGRRV | | NYTMDVFELK | | STGPRKVGYW | | NDMDKLVLIQ |
| DVPTLGNDTA | | AIENRTVVVT | | TIMESPYVMY | | KKNHEMFEGN | | DKYEGYCVDL |
| ASEIAKHIGI | | KYKIAIVPDG | | KYGARDADTK | | IWNGMVGELV | | YGKAEIAIAP |
| LTITLVREEV | | IDFSKPFMSL | | GISIMIKKPQ | | KSKPGVFSFL | | DPLAYEIWMC |
| IVFAYIGVSV | | VLFLVSRFSP | | YEWHTEEPED | | GKEGPSDQPP | | NEFGIFNSLW |
| FSLGAFMQQG | | CDISPRSLSG | | RIVGGVWWFF | | TLIIISSYTA | | NLAAFLTVER |
| MVSPIESAED | | LAKQTEIAYG | | TLDSGSTKEF | | FRRSKIAVYE | | KMWTYMRSAE |
| PSVFTRTTAE | | GVARVRKSKG | | KFAFLLESTM | | NEYIEQRKPC | | DTMKVGGNLD |
| SKGYGVATPK | | GSSLRTPVNL | | AVLKLSEAGV | | LDKLKNKWWY | | DKGECGPKDS |
| GSKDKTSALS | | LSNVAGVFYI | | LVGGLGLAML | | VALIEFCYKS | | RAEAKRMKLT |
| FSEAIRNKAR | | LSITGSVGEN | | GRVLTPDCPK | | AVHTGTAIRQ | | SSGLAVIASD |
| LP |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з GRIA4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIA4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4574 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P48058 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
