MYO5B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4J5M, 4LNZ, 4LWZ, 4LX0

Ідентифікатори

Символи

MYO5B, myosin VB, MVID1, DIAR2, PFIC10

Зовнішні ІД

OMIM: 606540 MGI: 106598 HomoloGene: 49481 GeneCards: MYO5B

Пов'язані генетичні захворювання

microvillus inclusion disease^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • calmodulin binding • microfilament motor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • cytoskeletal motor activity • ATP binding • actin filament binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • recycling endosome • apical cortex • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • myosin complex • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• renal water homeostasis • protein transport • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт • endosomal transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4645


17919

Ensembl


ENSG00000167306


ENSMUSG00000025885

UniProt


Q9ULV0


P21271

RefSeq (мРНК)


NM_001080467


NM_008661 NM_201600

RefSeq (білок)


NP_001073936


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 18: 49.82 – 50.2 Mb

Хр. 18: 74.57 – 74.9 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MYO5B (англ. Myosin VB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 848 амінокислот, а молекулярна маса — 213 672^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVGELYSQC	TRVWIPDPDE	VWRSAELTKD	YKEGDKSLQL	RLEDETILEY
PIDVQRNQLP	FLRNPDILVG	ENDLTALSYL	HEPAVLHNLK	VRFLESNHIY
TYCGIVLVAI	NPYEQLPIYG	QDVIYTYSGQ	NMGDMDPHIF	AVAEEAYKQM
ARDEKNQSII	VSGESGAGKT	VSAKYAMRYF	ATVGGSASET	NIEEKVLASS
PIMEAIGNAK	TTRNDNSSRF	GKYIQIGFDK	RYHIIGANMR	TYLLEKSRVV
FQADDERNYH	IFYQLCAAAG	LPEFKELALT	SAEDFFYTSQ	GGDTSIEGVD
DAEDFEKTRQ	AFTLLGVKES	HQMSIFKIIA	SILHLGSVAI	QAERDGDSCS
ISPQDVYLSN	FCRLLGVEHS	QMEHWLCHRK	LVTTSETYVK	TMSLQQVINA
RNALAKHIYA	QLFGWIVEHI	NKALHTSLKQ	HSFIGVLDIY	GFETFEVNSF
EQFCINYANE	KLQQQFNSHV	FKLEQEEYMK	EQIPWTLIDF	YDNQPCIDLI
EAKLGILDLL	DEECKVPKGT	DQNWAQKLYD	RHSSSQHFQK	PRMSNTAFII
VHFADKVEYL	SDGFLEKNRD	TVYEEQINIL	KASKFPLVAD	LFHDDKDPVP
ATTPGKGSSS	KISVRSARPP	MKVSNKEHKK	TVGHQFRTSL	HLLMETLNAT
TPHYVRCIKP	NDEKLPFHFD	PKRAVQQLRA	CGVLETIRIS	AAGYPSRWAY
HDFFNRYRVL	VKKRELANTD	KKAICRSVLE	NLIKDPDKFQ	FGRTKIFFRA
GQVAYLEKLR	ADKFRTATIM	IQKTVRGWLQ	KVKYHRLKGA	TLTLQRYCRG
HLARRLAEHL	RRIRAAVVLQ	KHYRMQRARQ	AYQRVRRAAV	VIQAFTRAMF
VRRTYRQVLM	EHKATTIQKH	VRGWMARRHF	QRLRDAAIVI	QCAFRMLKAR
RELKALRIEA	RSAEHLKRLN	VGMENKVVQL	QRKIDEQNKE	FKTLSEQLSV
TTSTYTMEVE	RLKKELVHYQ	QSPGEDTSLR	LQEEVESLRT	ELQRAHSERK
ILEDAHSREK	DELRKRVADL	EQENALLKDE	KEQLNNQILC	QSKDEFAQNS
VKENLMKKEL	EEERSRYQNL	VKEYSQLEQR	YDNLRDEMTI	IKQTPGHRRN
PSNQSSLESD	SNYPSISTSE	IGDTEDALQQ	VEEIGLEKAA	MDMTVFLKLQ
KRVRELEQER	KKLQVQLEKR	EQQDSKKVQA	EPPQTDIDLD	PNADLAYNSL
KRQELESENK	KLKNDLNELR	KAVADQATQN	NSSHGSPDSY	SLLLNQLKLA
HEELEVRKEE	VLILRTQIVS	ADQRRLAGRN	AEPNINARSS	WPNSEKHVDQ
EDAIEAYHGV	CQTNSKTEDW	GYLNEDGELG	LAYQGLKQVA	RLLEAQLQAQ
SLEHEEEVEH	LKAQLEALKE	EMDKQQQTFC	QTLLLSPEAQ	VEFGVQQEIS
RLTNENLDLK	ELVEKLEKNE	RKLKKQLKIY	MKKAQDLEAA	QALAQSERKR
HELNRQVTVQ	RKEKDFQGML	EYHKEDEALL	IRNLVTDLKP	QMLSGTVPCL
PAYILYMCIR	HADYTNDDLK	VHSLLTSTIN	GIKKVLKKHN	DDFEMTSFWL
SNTCRLLHCL	KQYSGDEGFM	TQNTAKQNEH	CLKNFDLTEY	RQVLSDLSIQ
IYQQLIKIAE	GVLQPMIVSA	MLENESIQGL	SGVKPTGYRK	RSSSMADGDN
SYCLEAIIRQ	MNAFHTVMCD	QGLDPEIILQ	VFKQLFYMIN	AVTLNNLLLR
KDVCSWSTGM	QLRYNISQLE	EWLRGRNLHQ	SGAVQTMEPL	IQAAQLLQLK
KKTQEDAEAI	CSLCTSLSTQ	QIVKILNLYT	PLNEFEERVT	VAFIRTIQAQ
LQERNDPQQL	LLDAKHMFPV	LFPFNPSSLT	MDSIHIPACL	NLEFLNEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Erickson R.P., Larson-Thome K., Valenzuela R.K., Whitaker S.E., Shub M.D. (2008). Navajo microvillous inclusion disease is due to a mutation in MYO5B. Am. J. Med. Genet. A. 146A: 3117—3119. PMID 19006234 DOI:10.1002/ajmg.a.32605

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з MYO5B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7603 (англ.) . Архів оригіналу за 20 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9ULV0 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3