TRIOBP

Ідентифікатори

Символи

TRIOBP, DFNB28, TAP68, TARA, dJ37E16.4, HRIHFB2122, TRIO and F-actin binding protein

Зовнішні ІД

OMIM: 609761 MGI: 1349410 HomoloGene: 5104 GeneCards: TRIOBP

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal recessive nonsyndromic deafness 28^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin filament binding • actin binding • ubiquitin protein ligase binding • myosin II binding
Клітинна компонента	• focal adhesion • центр організації мікротрубочок • клітинне ядро • цитоскелет • midbody • actin cytoskeleton • цитоплазма
Біологічний процес	• barbed-end actin filament capping • regulation of actin cytoskeleton organization • клітинний цикл • поділ клітини • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • actin modification • слух • auditory receptor cell stereocilium organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11078


110253

Ensembl


ENSG00000100106


ENSMUSG00000033088

UniProt


Q9H2D6


Q99KW3

RefSeq (мРНК)


NM_138632 NM_001039141 NM_007032


NM_001024716 NM_001039155 NM_001039156 NM_138579

RefSeq (білок)


NP_001034230 NP_008963 NP_619538


NP_001019887 NP_001034244 NP_001034245 NP_613045

Локус (UCSC)

Хр. 22: 37.7 – 37.78 Mb

Хр. 15: 78.83 – 78.89 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIOBP (англ. TRIO and F-actin binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 365 амінокислот, а молекулярна маса — 261 376^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEVPGDALC	EHFEANILTQ	NRCQNCFHPE	EAHGARYQEL	RSPSGAEVPY
CDLPRCPPAP	EDPLSASTSG	CQSVVDPGLR	PGPKRGPSPS	AGLPEEGPTA
APRSRSRELE	AVPYLEGLTT	SLCGSCNEDP	GSDPTSSPDS	ATPDDTSNSS
SVDWDTVERQ	EEEAPSWDEL	AVMIPRRPRE	GPRADSSQRA	PSLLTRSPVG
GDAAGQKKED	TGGGGRSAGQ	HWARLRGESG	LSLERHRSTL	TQASSMTPHS
GPRSTTSQAS	PAQRDTAQAA	STREIPRASS	PHRITQRDTS	RASSTQQEIS
RASSTQQETS	RASSTQEDTP	RASSTQEDTP	RASSTQWNTP	RASSPSRSTQ
LDNPRTSSTQ	QDNPQTSFPT	CTPQRENPRT	PCVQQDDPRA	SSPNRTTQRE
NSRTSCAQRD	NPKASRTSSP	NRATRDNPRT	SCAQRDNPRA	SSPSRATRDN
PTTSCAQRDN	PRASRTSSPN	RATRDNPRTS	CAQRDNPRAS	SPSRATRDNP
TTSCAQRDNP	RASRTSSPNR	ATRDNPRTSC	AQRDNPRASS	PNRAARDNPT
TSCAQRDNPR	ASRTSSPNRA	TRDNPRTSCA	QRDNPRASSP	NRATRDNPTT
SCAQRDNPRA	SRTSSPNRAT	RDNPRTSCAQ	RDNPRASSPN	RTTQQDSPRT
SCARRDDPRA	SSPNRTIQQE	NPRTSCALRD	NPRASSPSRT	IQQENPRTSC
AQRDDPRASS	PNRTTQQENP	RTSCARRDNP	RASSRNRTIQ	RDNPRTSCAQ
RDNPRASSPN	RTIQQENLRT	SCTRQDNPRT	SSPNRATRDN	PRTSCAQRDN
LRASSPIRAT	QQDNPRTCIQ	QNIPRSSSTQ	QDNPKTSCTK	RDNLRPTCTQ
RDRTQSFSFQ	RDNPGTSSSQ	CCTQKENLRP	SSPHRSTQWN	NPRNSSPHRT
NKDIPWASFP	LRPTQSDGPR	TSSPSRSKQS	EVPWASIALR	PTQGDRPQTS
SPSRPAQHDP	PQSSFGPTQY	NLPSRATSSS	HNPGHQSTSR	TSSPVYPAAY
GAPLTSPEPS	QPPCAVCIGH	RDAPRASSPP	RYLQHDPFPF	FPEPRAPESE
PPHHEPPYIP	PAVCIGHRDA	PRASSPPRHT	QFDPFPFLPD	TSDAEHQCQS
PQHEPLQLPA	PVCIGYRDAP	RASSPPRQAP	EPSLLFQDLP	RASTESLVPS
MDSLHECPHI	PTPVCIGHRD	APSFSSPPRQ	APEPSLFFQD	PPGTSMESLA
PSTDSLHGSP	VLIPQVCIGH	RDAPRASSPP	RHPPSDLAFL	APSPSPGSSG
GSRGSAPPGE	TRHNLEREEY	TVLADLPPPR	RLAQRQPGPQ	AQCSSGGRTH
SPGRAEVERL	FGQERRKSEA	AGAFQAQDEG	RSQQPSQGQS	QLLRRQSSPA
PSRQVTMLPA	KQAELTRRSQ	AEPPHPWSPE	KRPEGDRQLQ	GSPLPPRTSA
RTPERELRTQ	RPLESGQAGP	RQPLGVWQSQ	EEPPGSQGPH	RHLERSWSSQ
EGGLGPGGWW	GCGEPSLGAA	KAPEGAWGGT	SREYKESWGQ	PEAWEEKPTH
ELPRELGKRS	PLTSPPENWG	GPAESSQSWH	SGTPTAVGWG	AEGACPYPRG
SERRPELDWR	DLLGLLRAPG	EGVWARVPSL	DWEGLLELLQ	ARLPRKDPAG
HRDDLARALG	PELGPPGTND	VPEQESHSQP	EGWAEATPVN	GHSPALQSQS
PVQLPSPACT	STQWPKIKVT	RGPATATLAG	LEQTGPLGSR	STAKGPSLPE
LQFQPEEPEE	SEPSRGQDPL	TDQKQADSAD	KRPAEGKAGS	PLKGRLVTSW
RMPGDRPTLF	NPFLLSLGVL	RWRRPDLLNF	KKGWMSILDE	PGEPPSPSLT
TTSTSQWKKH	WFVLTDSSLK	YYRDSTAEEA	DELDGEIDLR	SCTDVTEYAV
QRNYGFQIHT	KDAVYTLSAM	TSGIRRNWIE	ALRKTVRPTS	APDVTKLSDS
NKENALHSYS	TQKGPLKAGE	QRAGSEVISR	GGPRKADGQR	QALDYVELSP
LTQASPQRAR	TPARTPDRLA	KQEELERDLA	QRSEERRKWF	EATDSRTPEV
PAGEGPRRGL	GAPLTEDQQN	RLSEEIEKKW	QELEKLPLRE	NKRVPLTALL
NQSRGERRGP	PSDGHEALEK	EVQALRAQLE	AWRLQGEAPQ	SALRSQEDGH
IPPGYISQEA	CERSLAEMES	SHQQVMEELQ	RHHERELQRL	QQEKEWLLAE
ETAATASAIE	AMKKAYQEEL	SRELSKTRSL	QQGPDGLRKQ	HQSDVEALKR
ELQVLSEQYS	QKCLEIGALM	RQAEEREHTL	RRCQQEGQEL	LRHNQELHGR
LSEEIDQLRG	FIASQGMGNG	CGRSNERSSC	ELEVLLRVKE	NELQYLKKEV
QCLRDELQMM	QKDKRFTSGK	YQDVYVELSH	IKTRSEREIE	QLKEHLRLAM
AALQEKESMR	NSLAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 DOI:10.1093/dnares/8.1.1
Seipel K., O'Brien S.P., Iannotti E., Medley Q.G., Streuli M. (2001). Tara, a novel F-actin binding protein, associates with the Trio guanine nucleotide exchange factor and regulates actin cytoskeletal organization. J. Cell Sci. 114: 389—399. PMID 11148140

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRIOBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17009 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H2D6 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3