SPTBN4

Ідентифікатори

Символи

SPTBN4, QV, SPNB4, SPTBN3, spectrin beta, non-erythrocytic 4, CMND, NEDHND

Зовнішні ІД

OMIM: 606214 MGI: 1890574 HomoloGene: 11879 GeneCards: SPTBN4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatase binding • spectrin binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ankyrin binding • actin binding • phospholipid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • PML body • spectrin • мембрана • cell body fiber • nuclear matrix • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • node of Ranvier • аксон • neuronal cell body • cell cortex • аксонний горбик • axon initial segment • paranode region of axon • екзосома • цитоскелет • intercalated disc
Біологічний процес	• clustering of voltage-gated sodium channels • аксоноґенеза • regulation of sodium ion transport • transmission of nerve impulse • слух • negative regulation of heart rate • MAPK cascade • axon guidance • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • розмножувальний процес • adult behavior • cardiac conduction • regulation of peptidyl-serine phosphorylation • actin filament capping • positive regulation of multicellular organism growth • запліднення • central nervous system projection neuron axonogenesis • vesicle-mediated transport • adult walking behavior • protein localization to plasma membrane • regulation of molecular function • cytoskeleton organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57731


80297

Ensembl


ENSG00000160460


ENSMUSG00000011751

UniProt


Q9H254


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_020971 NM_025213


NM_001199234 NM_001199235 NM_001199236 NM_032610

RefSeq (білок)


NP_066022 NP_079489


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 40.47 – 40.58 Mb

Хр. 7: 27.06 – 27.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPTBN4 (англ. Spectrin beta, non-erythrocytic 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 564 амінокислот, а молекулярна маса — 288 985^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQVPGEVDN	MEGLPAPNNN	PAARWESPDR	GWEREQPAAS	TAAASLFECS
RIKALADERE	AVQKKTFTKW	VNSHLARVGC	HIGDLYVDLR	DGFVLTRLLE
VLSGEQLPRP	TRGRMRIHSL	ENVDKALQFL	KEQRVHLENV	GSHDIVDGNH
RLTLGLVWTI	ILRFQIQVIK	IETEDNRETR	SAKDALLLWC	QMKTAGYPEV
NIQNFTTSWR	DGLAFNALIH	RHRPDLVDFS	KLTKSNANYN	LQRAFRTAEQ
HLGLARLLDP	EDVNMEAPDE	KSIITYVVSF	YHYFSKMKAL	AVEGKRIGKV
LDQVLEVGKI	IERYEELAAE	LLAWIHRTVG	LISNQKFANS	LSGVQQQLQA
FTAYCTLEKP	VKFQEKGNLE	VLLFSIQSKL	RACNRRLFVP	REGCGIWDID
KAWGELEKAE	HEREAALRAE	LIRQEKLELL	AQRFDHKVAM	RESWLNENQR
LVSQDNFGYE	LPAVEAAMKK	HEAIEADIAA	YEERVQGVAE	LAQALAAEGY
YDIRRVAAQR	DSVLRQWALL	TGLVGARRTR	LEQNLALQKV	FQEMVYMVDW
MEEMQAQLLS	RECGQHLVEA	DDLLQKHGLL	EGDIAAQSER	VEALNAAALR
FSQLQGYQPC	DPQVICNRVN	HVHGCLAELQ	EQAARRRAEL	EASRSLWALL
QELEEAESWA	RDKERLLEAA	GGGGAAGAAG	AAGTAGGAHD	LSSTARLLAQ
HKILQGELGG	RRALLQQALR	CGEELVAAGG	AVGPGADTVH	LVGLAERAAS
ARRRWQRLEE	AAARRERRLQ	EARALHQFGA	DLDGLLDWLR	DAYRLAAAGD
FGHDEASSRR	LARQHRALTG	EVEAHRGPVS	GLRRQLATLG	GASGAGPLVV
ALQVRVVEAE	QLFAEVTEVA	ALRRQWLRDA	LAVYRMFGEV	HACELWIGEK
EQWLLSMRVP	DSLDDVEVVQ	HRFESLDQEM	NSLMGRVLDV	NHTVQELVEG
GHPSSDEVRS	CQDHLNSRWN	RIVELVEQRK	EEMSAVLLVE	NHVLEVAEVR
AQVREKRRAV	ESAPRAGGAL	QWRLSGLEAA	LQALEPRQAA	LLEEAALLAE
RFPAQAARLH	QGAEELGAEW	GALASAAQAC	GEAVAAAGRL	QRFLHDLDAF
LDWLVRAQEA	AGGSEGPLPN	SLEEADALLA	RHAALKEEVD	QREEDYARIV
AASEALLAAD	GAELGPGLAL	DEWLPHLELG	WHKLLGLWEA	RREALVQAHI
YQLFLRDLRQ	ALVVLRNQEM	ALSGAELPGT	VESVEEALKQ	HRDFLTTMEL
SQQKMQVAVQ	AAEGLLRQGN	IYGEQAQEAV	TRLLEKNQEN	QLRAQQWMQK
LHDQLELQHF	LRDCHELDGW	IHEKMLMARD	GTREDNHKLH	KRWLRHQAFM
AELAQNKEWL	EKIEREGQQL	MQEKPELAAS	VRKKLGEIRQ	CWAELESTTQ
AKARQLFEAS	KADQLVQSFA	ELDKKLLHME	SQLQDVDPGG	DLATVNSQLK
KLQSMESQVE	EWYREVGELQ	AQTAALPLEP	ASKELVGERQ	NAVGERLVRL
LEPLQERRRL	LLASKELHQV	AHDLDDELAW	VQERLPLAMQ	TERGNGLQAV
QQHIKKNQGL	RREIQAHGPR	LEEVLERAGA	LASLRSPEAE	AVRRGLEQLQ
SAWAGLREAA	ERRQQVLDAA	FQVEQYYFDV	AEVEAWLGEQ	ELLMMSEDKG
KDEQSTLQLL	KKHLQLEQGV	ENYEESIAQL	SRQCRALLEM	GHPDSEQISR
RQSQVDRLYV	ALKELGEERR	VALEQQYWLY	QLSRQVSELE	HWIAEKEVVA
GSPELGQDFE	HVSVLQEKFS	EFASETGMAG	RERLAAVNQM	VDELIECGHT
AAATMAEWKD	GLNEAWAELL	ELMGTRAQLL	AASRELHKFF	SDARELQGQI
EEKRRRLPRL	TTPPEPRPSA	SSMQRTLRAF	EHDLQLLVSQ	VRQLQEGAAQ
LRTVYAGEHA	EAIASREQEV	LQGWKELLSA	CEDARLHVSS	TADALRFHSQ
VRDLLSWMDG	IASQIGAADK	PRDVSSVEVL	MNYHQGLKTE	LEARVPELTT
CQELGRSLLL	NKSAMADEIQ	AQLDKLGTRK	EEVSEKWDRH	WEWLQQMLEV
HQFAQEAVVA	DAWLTAQEPL	LQSRELGSSV	DEVEQLIRRH	EAFRKAAAAW
EERFSSLRRL	TTIEKIKAEQ	SKQPPTPLLG	RKFFGDPTEL	AAKAAPLLRP
GGYERGLEPL	ARRASDTLSA	EVRTRVGYVR	QELKPERLQP	RIDRLPEIPG
RVEPAALPAA	PEDAAETPAT	PAAAEQVRPR	PERQESADRA	EELPRRRRPE
RQESVDQSEE	AARRRRPERQ	ESAEHEAAHS	LTLGRYEQME	RRRERRERRL
ERQESSEQEM	PIRGDLVKGK	ATLADIVEQL	QEKEAGPGLP	AGPSLPQPRE
LPPGRLPNGL	ELPERTPRPD	RPRARDRPKP	RRRPRPREGG	EGGGSRRSRS
APAQGGSAPA	PPPPPTHTVQ	HEGFLLRKRE	LDANRKSSNR	SWVSLYCVLS
KGELGFYKDS	KGPASGSTHG	GEPLLSLHKA	TSEVASDYKK	KKHVFKLQTQ
DGSEFLLQAK	DEEEMNGWLE	AVASSVAEHA	EIARWGQTLP	TTSSTDEGNP
KREGGDRRAS	GRRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до кепінгів актину. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14896 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H254 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3