NKX2-3

NKX2-3
Ідентифікатори
Символи NKX2-3, CSX3, NK2.3, NKX2.3, NKX2C, NKX4-3, NK2 homeobox 3
Зовнішні ІД OMIM: 606727 MGI: 97348 HomoloGene: 17061 GeneCards: NKX2-3
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
молекулярна функція
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity

Клітинна компонента

клітинне ядро
компонент клітини

Біологічний процес

leukocyte homeostasis
CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation
post-embryonic digestive tract morphogenesis
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
plasma cell differentiation
spleen development
post-embryonic development
transcription, DNA-templated
macrophage differentiation
mucosa-associated lymphoid tissue development
odontogenesis of dentin-containing tooth
gland morphogenesis
regulation of cell population proliferation
GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
B cell differentiation
Peyer's patch development
digestive tract development
lymph node development
triglyceride metabolic process
leukocyte migration
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0022610 життєдіяльність
диференціація клітин

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
159296
18089
Ensembl
ENSG00000119919
ENSMUSG00000044220
UniProt
Q8TAU0
P97334
RefSeq (мРНК)
NM_145285
NM_008699
RefSeq (білок)
NP_660328
NP_032725
Локус (UCSC) Хр. 10: 99.53 – 99.54 Mb Хр. 19: 43.6 – 43.6 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NKX2-3 (англ. NK2 homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 38 406[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMLPSPVTSTPFSVKDILNLEQQHQHFHGAHLQADLEHHFHSAPCMLAAA
EGTQFSDGGEEDEEDEGEKLSYLNSLAAADGHGDSGLCPQGYVHTVLRDS
CSEPKEHEEEPEVVRDRSQKSCQLKKSLETAGDCKAAEESERPKPRSRRK
PRVLFSQAQVFELERRFKQQRYLSAPEREHLASSLKLTSTQVKIWFQNRR
YKCKRQRQDKSLELGAHAPPPPPRRVAVPVLVRDGKPCVTPSAQAYGAPY
SVGASAYSYNSFPAYGYGNSAAAAAAAAAAAAAAAAYSSSYGCAYPAGGG
GGGGGTSAATTAMQPACSAAGGGPFVNVSNLGGFGSGGSAQPLHQGTAAG
AACAQGTLQGIRAW

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7836 (англ.) . Архів оригіналу за 1 липня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q8TAU0 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 10
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші