TAF1

TAF1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1EQF, 3AAD, 3UV4, 3UV5, 4RGW, 4YYM, 4YYN, 5I29, 5I1Q, 5FUR

Ідентифікатори
Символи TAF1, BA2R, CCG1, CCGS, DYT3, DYT3/KAT4, N-NSCL2, OF, P250, TAF(II)250, TAF2A, TAFII-250, TAFII250, XDP, MRXS33, TATA-box binding protein associated factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 313650 MGI: 1336878 HomoloGene: 37942 GeneCards: TAF1
Пов'язані генетичні захворювання
X-linked dystonia-parkinsonism[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

transferase activity
nucleotide binding
DNA binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
p53 binding
transcription factor binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
lysine-acetylated histone binding
TBP-class protein binding
acyltransferase activity
ATP binding
protein serine/threonine kinase activity
histone acetyltransferase activity
kinase activity
protein heterodimerization activity
H3K27me3 modified histone binding
ubiquitin conjugating enzyme activity
acetyl-CoA binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity

Клітинна компонента

нуклеоплазма
MLL1 complex
клітинне ядро
ядерце
transcription regulator complex
transcription factor TFIID complex

Біологічний процес

фосфорилювання
RNA polymerase II preinitiation complex assembly
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter
transcription, DNA-templated
GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation
DNA-templated transcription, initiation
protein autophosphorylation
клітинний цикл
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
peptidyl-threonine phosphorylation
positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of signal transduction by p53 class mediator
GO:0022415 viral process
histone acetylation
protein polyubiquitination
protein phosphorylation
cellular response to DNA damage stimulus
negative regulation of gene expression
midbrain development
positive regulation of protein binding
cellular response to UV
transcription factor catabolic process
protein stabilization
regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter
cellular response to ATP
regulation of cell cycle G1/S phase transition
negative regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding
negative regulation of protein autoubiquitination
negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process
positive regulation of androgen receptor activity
positive regulation of transcription by RNA polymerase I
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to UV-induced DNA damage
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
ubiquitin-dependent protein catabolic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6872
270627
Ensembl
ENSG00000147133
ENSMUSG00000031314
UniProt
P21675
Q80UV9
RefSeq (мРНК)
NM_001286074
NM_004606
NM_138923
NM_001081008
NM_001290729
RefSeq (білок)
NP_001273003
NP_004597
NP_620278
NP_001277658
NP_001392888
NP_001392889
NP_001392890
NP_001392891
Локус (UCSC) Хр. X: 71.37 – 71.53 Mb Хр. X: 100.58 – 100.65 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TAF1 (англ. TATA-box binding protein associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 872 амінокислот, а молекулярна маса — 212 677[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGPGCDLLLRTAATITAAAIMSDTDSDEDSAGGGPFSLAGFLFGNINGAG
QLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGSLITELTANEELTGTDGALVNDEGW
VRSTEDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHSDYDEDDYDADCED
IDCKLMPPPPPPPGPMKKDKDQDSITGEKVDFSSSSDSESEMGPQEATQA
ESEDGKLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKN
VPSVWRSARRKRKKKHRELIQEEQIQEVECSVESEVSQKSLWNYDYAPPP
PPEQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDIDKVTDTKPRVAEWRYGPARLWY
DMLGVPEDGSGFDYGFKLRKTEHEPVIKSRMIEEFRKLEENNGTDLLADE
NFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNV
QQGFAATLDDDKPWYSIFPIDNEDLVYGRWEDNIIWDAQAMPRLLEPPVL
TLDPNDENLILEIPDEKEEATSNSPSKESKKESSLKKSRILLGKTGVIKE
EPQQNMSQPEVKDPWNLSNDEYYYPKQQGLRGTFGGNIIQHSIPAVELRQ
PFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGALSQPGPHSVQPLLKHIKKKAKMR
EQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATKI
KNYYKRKPGKDPGAPDCKYGETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRA
PIYLHKMPETDFLIIRTRQGYYIRELVDIFVVGQQCPLFEVPGPNSKRAN
THIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCA
DFKRTGMDSNWWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKD
AGYGEKSFFAPEEENEEDFQMKIDDEVRTAPWNTTRAFIAAMKGKCLLEV
TGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDKEPQPVKKTVTGTDADLRRLSL
KNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFARG
SRFSVAEHQERYKEECQRIFDLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEM
GKNIENMLQNKKTSSQLSREREEQERKELQRMLLAAGSAASGNNHRDDDT
ASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKPAVIDAYVRIRTT
KDEEFIRKFALFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKK
PKKMKERPDLKLKCGACGAIGHMRTNKFCPLYYQTNAPPSNPVAMTEEQE
EELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQLIESADEVRRKSLVLKFPKQQL
PPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLP
NTYPFHTPVNAKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLE
LIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLARLEKAINPLLD
DDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDL
ETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVC
YQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAELESLDPMTPGPYTPQPPDLY
DTNTSLSMSRDASVFQDESNMSVLDIPSATPEKQVTQEGEDGDGDLADEE
EGTVQQPQASVLYEDLLMSEGEDDEEDAGSDEEGDNPFSAIQLSESGSDS
DVGSGGIRPKQPRMLQENTRMDMENEESMMSYEGDGGEASHGLEDSNISY
GSYEEPDPKSNTQDTSFSSIGGYEVSEEEEDEEEEEQRSGPSVLSQVHLS
EDEEDSEDFHSIAGDSDLDSDE

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Sekiguchi T., Nohiro Y., Nakamura Y., Hisamoto N., Nishimoto T. (1991). The human CCG1 gene, essential for progression of the G1 phase, encodes a 210-kilodalton nuclear DNA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 11: 3317—3325. PMID 2038334 DOI:10.1128/MCB.11.6.3317
  • Ruppert S., Wang E.H., Tjian R. (1993). Cloning and expression of human TAFII250: a TBP-associated factor implicated in cell-cycle regulation. Nature. 362: 175—179. PMID 7680771 DOI:10.1038/362175a0
  • Nolte D., Niemann S., Muller U. (2003). Specific sequence changes in multiple transcript system DYT3 are associated with X-linked dystonia parkinsonism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 10347—10352. PMID 12928496 DOI:10.1073/pnas.1831949100
  • Herzfeld T., Nolte D., Muller U. (2007). Structural and functional analysis of the human TAF1/DYT3 multiple transcript system. Mamm. Genome. 18: 787—795. PMID 17952504 DOI:10.1007/s00335-007-9063-z
  • Dikstein R., Ruppert S., Tjian R. (1996). TAFII250 is a bipartite protein kinase that phosphorylates the base transcription factor RAP74. Cell. 84: 781—790. PMID 8625415 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81055-7
  • Damania B., Alwine J.C. (1996). TAF-like function of SV40 large T antigen. Genes Dev. 10: 1369—1381. PMID 8647434 DOI:10.1101/gad.10.11.1369

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11535 (англ.) . Архів оригіналу за 25 липня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
  5. UniProt, P21675 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші