TAF8 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4WV6, 5FUR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TAF8, 43, II, TAF, TAFII-43, TAFII43, TBN, TATA-box binding protein associated factor 8, TAF(II)43 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609514 MGI: 1926879 HomoloGene: 11094 GeneCards: TAF8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription factor TFIID complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of fat cell differentiation • transcription, DNA-templated • maintenance of protein location in nucleus • inner cell mass cell proliferation • snRNA transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 42.05 – 42.09 Mb | Хр. 17: 47.79 – 47.81 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TAF8 (англ. TATA-box binding protein associated factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 34 262[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADAAATAGA | | GGSGTRSGSK | | QSTNPADNYH | | LARRRTLQVV | | VSSLLTEAGF |
ESAEKASVET | | LTEMLQSYIS | | EIGRSAKSYC | | EHTARTQPTL | | SDIVVTLVEM |
GFNVDTLPAY | | AKRSQRMVIT | | APPVTNQPVT | | PKALTAGQNR | | PHPPHIPSHF |
PEFPDPHTYI | | KTPTYREPVS | | DYQVLREKAA | | SQRRDVERAL | | TRFMAKTGET |
QSLFKDDVST | | FPLIAARPFT | | IPYLTALLPS | | ELEMQQMEET | | DSSEQDEQTD |
TENLALHISM | | EDSGAEKENT | | SVLQQNPSLS | | GSRNGEENII | | DNPYLRPVKK |
PKIRRKKSLS |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Guermah M., Ge K., Chiang C.-M., Roeder R.G. (2003). The TBN protein, which is essential for early embryonic mouse development, is an inducible TAFII implicated in adipogenesis. Mol. Cell. 12: 991—1001. PMID 14580349 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00396-4
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17300 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z7C8 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|